Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CARMN-210ENST00000602964 8398 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HERVK_113P61574 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms