Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2FP61218 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms