Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RWDD2BP57060 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms