Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCA4P51532 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms