Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCA2P51531 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCA2P51531 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms