Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FNTAP49354 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FNTAP49354 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms