Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A3P48751 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms