Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
CDKN1BP46527 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CDKN1BP46527 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms