Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MLH1P40692 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MLH1P40692 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms