Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms