Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5DP30049 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms