Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms