Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PLNP26678 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PLNP26678 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms