Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMO2P25791 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO2P25791 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO2P25791 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO2P25791 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO2P25791 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO2P25791 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO2P25791 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO2P25791 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO2P25791 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO2P25791 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms