Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRGP23470 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRGP23470 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms