Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD58P19256 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD58P19256 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD58P19256 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD58P19256 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD58P19256 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD58P19256 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD58P19256 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD58P19256 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD58P19256 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD58P19256 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD58P19256 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD58P19256 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms