Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms