Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CREB1P16220 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms