Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC008040.1-204ENST00000469301 1738 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC131097.1-201ENST00000437438 739 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXB3P14651 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms