Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms