Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYL4P12829 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYL4P12829 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYL4P12829 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYL4P12829 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYL4P12829 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYL4P12829 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYL4P12829 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms