Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM225BP0DP42 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms