Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF40O75150 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF40O75150 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF40O75150 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms