Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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HOXA3O43365 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HOXA3O43365 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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