Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TO15178 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TO15178 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TO15178 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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