Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIPC1O14908 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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