Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA1C9JL84 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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