Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT4C9JH25 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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