Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms