Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TNFSF18Q9UNG2 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms