Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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SCML1Q9UN30 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SCML1Q9UN30 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SCML1Q9UN30 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SCML1Q9UN30 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SCML1Q9UN30 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SCML1Q9UN30 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SCML1Q9UN30 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SCML1Q9UN30 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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SCML1Q9UN30 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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SCML1Q9UN30 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCML1Q9UN30 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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