Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PALD1Q9ULE6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms