Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

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Length 1,331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTNAP2Q9UHC6 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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