Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLKQ9UBT6 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms