Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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DKK3Q9UBP4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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DKK3Q9UBP4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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DKK3Q9UBP4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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DKK3Q9UBP4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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DKK3Q9UBP4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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DKK3Q9UBP4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DKK3Q9UBP4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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