Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms