Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
USP35Q9P2H5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP35Q9P2H5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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