Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC180Q9P1Z9 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms