Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RAB18Q9NP72 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RAB18Q9NP72 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms