Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PUS3Q9BZE2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms