Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP2Q9BX26 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms