Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM12Q96EX1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms