Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CHFRQ96EP1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHFRQ96EP1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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