Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
GIPC3Q8TF64 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
GIPC3Q8TF64 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms