Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MYRIPQ8NFW9 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MYRIPQ8NFW9 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms