Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC50Q8IVM0 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms