Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPCAT2Q7L5N7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LPCAT2Q7L5N7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPCAT2Q7L5N7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPCAT2Q7L5N7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPCAT2Q7L5N7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPCAT2Q7L5N7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPCAT2Q7L5N7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LPCAT2Q7L5N7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPCAT2Q7L5N7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms