Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms