Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms