Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CHD9Q3L8U1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD9Q3L8U1 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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